中医临床基础学科自建校之初成立，主要进行《伤寒论》、《金匮要略》、《温病学》典籍的整理研究、理法方药的实验研究及临床研究工作，经过多年不懈的努力，学科已形成了以教学为中心，医疗为基础，科研为龙头的教、医、研相互促进，协调发展的模式。

学科于2000年获得硕士学位授予资格，现已形成经方防治肺系疾病的研究，经方防治消化系疾病、肿瘤及器官纤维化的研究，经方防治风湿病及更年期相关疾病的研究，外感热病辨证论治体系的研究等4个稳定的研究方向。2004年，中医临床基础学科被评为甘肃中医学院重点学科，2009年伤寒学被评为国家中医药管理局中医药重点学科（西部扶持项目）。

本学科现有成员共19名，学科带头人为李金田教授，学术带头人为李金田教授、周语平教授、牟惠琴教授。学科团队中教授及主任医师6人，副教授7人，讲师6人，比例为3.2:3.6:3.2，高级职称人员占学科总人数的68.4%。博士3人，硕士9人（其中3名博士研究生在读），学士7人，具有研究生及以上学历者占学科总人数的63.2%。团队35岁以下人员6名，36-45岁人员9名，45岁以上人员4名，45岁以下人员占学科总人数的78.9%。毕业于甘肃中医学院者7人，毕业于外院者12人，比例为3.7:6.3。学科成员毕业专业涵盖中医学、中西医结合、临床医学、药学等专业，现从事中医学、临床医学、临床中药学、药理学、生理学、免疫学、生物化学等专业教学、科研及临床工作。学科现已发展成为特点较为鲜明、学历层次较高、人才梯队及知识结构合理、教医研协调发展、具备较强教学及科研能力的学科。

现有硕士生导师3名，兼职博士生导师2名；已培养硕士研究生62名，在校研究生19人。其中1名教师获甘肃省高等学校教学名师奖，1名教师获甘肃省优秀教师“园丁奖”， 1名教师被评为甘肃省优秀专家，2名教师被评为省教委跨世纪学术技术带头人“333科技人才工程”第一、二层次人选及甘肃省高校跨世纪学科带头人，1名教师被选拔为甘肃省领军人才第二层次人选。2010年度本学科获甘肃省省级教学团队“中医临床基础教学团队”称号。

近5年来，学科成员先后主持或参与完成省级及以上科研项目8项，获省级科技进步奖2项、省教学成果奖3项。出版教材和专著15部，在国内外重要期刊和国际会议上发表论文70余篇，其中中文核心期刊14篇。目前承担省级以上科研项目14项，在研科研经费82万元。《伤寒学》、《温病学》课程均被评为“甘肃省精品课程”。